Liebe Kolleginnen und Kollegen der MaterialDigital Community,
das Jahr neigt sich dem Ende zu. Zeit einmal innezuhalten und auf das Jahr zurückzuschauen. Auch bei der Plattform hat sich im letzten Jahr viel getan und wir sind in allen Bereichen ein großes Stück vorangekommen.
Die Community wächst und im Frühjahr haben wir unsere akademischen Projekte bei der Plattform begrüßen dürfen. Nach und nach haben die Projekte ihre Arbeit aufgenommen und steigen in die Kooperation mit der Plattform ein.
In der PMD haben wir unsere Arbeitsgruppen erweitert und neben Workflows, Ontologie und IT-Architektur nun auch eine Community Arbeitsgruppe etabliert. Alle Arbeitsgruppen haben einen Bereich im Forum und werden über Neuigkeiten berichten und mit Ihnen Fragen, Ideen und Anmerkungen diskutieren.
Gerne wollen wir Ihnen einen kurzen Überblick über die erreichten Meilensteine (Abb.1) der einzelnen Handlungsfelder geben.
Unsere Webseite wurde in diesem Jahr komplett überarbeitet. Für ein leichteres Verständnis wurde ebenfalls ein Glossar eingebaut. Seit neuestem gibt es eine Eventseite, auf der Sie immer die wichtigsten Termine der PMD und in der Community sehen können. Auch unser Flyer wurde überarbeitet und auf den neuesten Stand gebracht. Dieser wird in Kürze auf unserer Webseite verlinkt sein.
Neben unserem YouTube Kanal sind wir jetzt ebenfalls auf LinkedIn vertreten. Schauen Sie doch vorbei und folgen Sie uns für Stellenausschreibungen, Veranstaltungen und neueste Informationen.
Sowohl auf der Webseite als auch auf unserem YouTube Kanal ist nun unser erster Imagefilm zu sehen. Sie haben ihn noch nicht gesehen? Dann schauen Sie ihn sich gleich an. In gut 3 Minuten wird Ihnen das ganze Projekt in Kurzform erklärt. Untertitel (DE, EN) können optional hinzugeschalten werden.
Des Weiteren wird das Forum langsam mit Inhalten befüllt und viele der Diskussionen werden ins Forum verlegt. Für mehr Transparenz und um Ihnen die Möglichkeit zu geben, sich aktiv an den Diskussionen zu beteiligen. Mit Ihrem PMD-Account können Sie sich ganz einfach im Forum anmelden. Zudem werden wir im Forum Links zu allen von der PMD angebotenen und unterstützten Tools bündeln, so dass Sie hier einen schnellen Überblick erhalten können.
Ende November wurde an alle, die eine Industrieassoziation im Profil angegeben haben [1], eine Umfrage versendet. Diese Industrieumfrage soll eine Basis für die PMD darstellen, um die Interessen der Industrie stärker verfolgen zu können. Falls Sie diese Umfrage noch nicht ausgefüllt haben, nehmen Sie sich bitte 15 Minuten Zeit und helfen Sie uns, und/oder leiten Sie die Umfrage an Industriekontakte weiter. Auf Basis der Umfrageergebnisse soll die Strategie der Plattform angepasst werden, um die Bedürfnisse der Industrie besser erfüllen zu können. Mit Ihrem Beitrag helfen Sie uns in der weiteren Ausrichtung der PMD sehr weiter. Vielen Dank!
Auch für den DGM Adventskalender durften wir ein Türchen gestalten (1. Dezember) und haben der Ontologie des Zugversuchs einen weihnachtlichen Touch verliehen (Abb.2). Schauen Sie doch im Adventskalender vorbei, wenn Sie die Ontologie animiert und musikalisch untermalt sehen möchten.
Eine grundlegende Neuerung aus dem Bereich der IT-Architektur für alle Abonnenten und Abonnentinnen des Newsletters, war in diesem Jahr die Anbindung der Webseite an den PMD Single Sign On (SSO) Dienst. Dieser ermöglicht es, unter anderem mit denselben Zugangsdaten auch weitere Dienste der PMD, wie z. B. das Forum, zu nutzen. Sollten Sie Ihr Profil noch nicht mit dem PMD-SSO Dienst verknüpft haben, können Sie dies in Ihrem Profil unter "MaterialDigital SSO ID" vornehmen.
Eine weitere Neuerung war die Veröffentlichung des PMD Deployment Guides. Dieser stellt Anleitungen zur Verfügung, wie erste Dienste der PMD auf eigenen Ressourcen aufgesetzt werden können.
Für die Bereitstellung der PMD-spezifischen Anwendungen in Containern wurde weiterhin ein erster einfacher App Store entwickelt. Dieser soll als vertrauenswürdige Quelle für PMD-spezifische Anwendungen fungieren.
Auch die Arbeit an der dezentralen Infrastruktur der PMD wurde weiter vorangetrieben. Dazu wurde der Protoyp eines PMD-Mesh, ein WireGuard VPN, als alternative Verbindung zwischen PMD-Instanzen konzipiert und instanziiert.
Innerhalb der IT-Architekturgruppe wurden weiterhin Konzepte erarbeitet, wie mittels JSON Web Tokens (JWT) Workflow- und Ontologiedienste miteinander verknüpft werden können.
In diesem Jahr ging unser PMD Workflowstore online und wurden mit den ersten Workflows befüllt. Dazu wurde u.a. ein gemeinsamer Metadatenstandard für Workflows erarbeitet, der es ermöglicht, Workflows in einem einheitlichen Format darzustellen und die Grundlage für geplante Funktionalitäten des Stores, wie z.B. Validierung, Sortierung oder Suche legt. Die kontinuierliche Weiterentwicklung der Workflowlösungen und der zugrundeliegenden Plattformen ist auch an zahlreichen Beispielen für komplette Workflows erkennbar, die sich auf dem GitHub Repository der PMD befinden.
Ein weiterer großer Aufgabenbereich war die Integration, der in diesem Jahr gestarteten Projekte. In einem Onboarding-Workshop wurde zunächst die Workflowgruppe sowie die beiden Workflowplattformen SimStack und pyiron vorgestellt. Im zweiten Teil konnten die Teilnehmenden dann selbst eigene Workflows erstellen und ausführen. Dazu wurde eine Workflow-Server bereitgestellt der auch nach dem Workshop für Interessierte zur Verfügung steht. Dies erfolgt mittels einer Webschnittstelle für pyiron oder den nun zum Download verfügbaren SimStack Client. Die Vorträge und Tutorials wurden zudem in den PMD YouTube Kanal gestellt, wo sie allen Interessierten zur Verfügung stehen.
Eine Umfrage lieferte erste Einblicke welche Workflowlösungen bereits genutzt werden und welche Programme es zu integrieren gilt. Die Hauptintegration erfolgte jedoch über die Aufnahme von Workflowexperten aus den Projekten in die Workflowgruppe. In wöchentlichen virtuellen Treffen wurden dabei die einzelnen Projekte, die neuesten Entwicklungen bei pyiron und SimStack, aber auch externe Tools aus der Community wie eLabFTW oder Simphony vorgestellt. Weitere Themen wie die Einbindung von Experimenten in Workflows wurden ebenfalls diskutiert.
Schließlich wurde auch von allen involvierten Projekten eine User Story erarbeitet, die die Anforderungen des Projekts an Workflows in der PMD umreißt. Im weiteren Verlauf sollen diese in das Forum übertragen werden und Grundlage für Diskussionen und die zukünftigen Workflowaktivitäten der PMD sowie der gesamten Community bilden.
Zusätzlich boten die Treffen aber auch externen Gästen die Möglichkeit, Kontakt zu der Workflowgruppe herzustellen. Unter Workflows auf der Webseite finden Interessierte nun auch direkt die Möglichkeit über das Forum oder ein Formular mit der Workflowgruppe in Kontakt zu treten.
Im Bereich Ontologie wurden in diesem Jahr die ersten Anwendungsontologien aufgebaut und veröffentlicht. Zudem wurde der OntoDocker aufgebaut und integriert. Die Funktionen umfassen die Authentifizierung via Single Sign On (SSO), das Management und Abfragen von Ontologien via Graphic User Interface (GUI) & Application Programming Interface (API), sowie die Visualisierung der Ontologien.
Mit dem Start der akademischen Projekte in Phase 2 musste erst einmal ein gemeinsames Format zur Bedarfsermittlung und der Abfrage des Kenntnisstandes der neuen Mitarbeitenden der Projekte eingeführt werden. Hierfür hat sich inzwischen einmal wöchentlich eine Ontologie-Austauschrunde etabliert, um die Projekte untereinander und mit der PMD zu vernetzen. Hier wird zusammen mit den Partnern und Partnerinnen die Ontologie Entwicklung harmonisiert. Erste Guides dahingehend wurden im gemeinsamen GitLab Repositorium bereitgestellt. Diese unterstützen die Mitarbeitenden hinsichtlich der Erarbeitung eigener Anwendungsontologien welche später mit der PMD Kernontologie (PMDco) kompatibel sein sollen. Mögliche Synergien zwischen den Partnerprojekten sollen dabei frühzeitig genutzt werden. Ein Kurationsprozess soll dabei die Weiterentwicklung der PMDco gewährleisten. Außerdem werden Anbindungen an andere Mid-Level Ontologien erörtert.
Im Jahr 2022 werden die industriell geführten MaterialDigital Projekte starten und uns damit immer näher an die Industrie heranführen. Wir sind sehr gespannt, welche Projekte uns erwarten werden. Auch diese Projekte werden, gemeinsam mit den akademisch geführten Projekten dabei helfen, die PMD weiter auszubauen und weitere industrieorientierte Aspekte einzubeziehen.
Mit der fortschreitenden Entwicklung der Plattform soll diese immer weiter für die Community geöffnet werden, um auch externe Mitarbeit zu vereinfachen und mehr Transparenz zu erzeugen. Das erste große Plattform Event soll im Frühjahr stattfinden, die erste Vollversammlung der PMD 2022. Wir werden Sie darüber rechtzeitig informieren und auf dem Laufenden halten.
Hiermit wünschen wir von der PMD unserer Community und dem gesamten Team einen ruhigen Jahresabschluss, frohe Feiertage und einen guten Start ins Jahr 2022. Auch das nächste Jahr hält mit dem Start der industriell geführten Projekte viele spannende Neuerungen für uns bereit. Wir hoffen sehr, Sie im nächsten Jahr bei der ein oder anderen PMD Veranstaltung, hoffentlich diesmal wirklich in Präsenz, begrüßen zu dürfen.
Bleiben Sie alle gesund und vielen Dank für Ihr Interesse und Ihre Beteiligung. Nehmen Sie bei Fragen oder Anregungen jederzeit Kontakt mit uns auf.
[1] Neben Nutzenden mit Industrieassoziation wurde die Umfrage auch an alle, die keine Angabe unter Organisation gemacht haben, versendet. Nutzen Sie doch die Gelegenheit um gegebenenfalls Ihr Profil zu aktualisieren.
Ihr PMD Team
